《风云2搜神篇》是继《风云梦情篇》的第二部力作，故事以步惊云为主角，历经一系列江湖风雨。游戏中玩家从无双城大战开始，由于追杀残余势力，被独孤剑打下山崖，失去记忆开始，一直到铲除江湖恶人。步惊云的命运将由玩家自己安排，或变成杀人魔王，或回到雄霸身边。
第一章 勇闯无双城
游戏开始讲述主人公步惊云奉雄霸之命攻打无双城，与无双城主发生战斗将其打败（无双城主能力偏低很容易就可以将他击败），就在斩草除根追杀独孤氏一族的路上，偶遇前任城主独孤剑，此时步惊云年轻气胜一时好强，不敌独孤剑（剧情需要，独孤剑的技能灭魂杀杀伤力很大,玩家不必惊讶）之后被打下山崖。
第二章 渔村探险
在山崖下的河中被渔民救起，但是步惊云失去记忆，和位于村子中央的村姑对话得到任务——到黑森林寻找叫小娜的小女孩（右下角的屋子中有供玩家恢复体力的木床），接着出村去大地图，黑森林位于大地图的东面，到了黑森林地图在中间的大树旁会得到信息提示，然后搜索此棵大树，找到调皮的小娜，回村交任务，回到村子与小娜对话会得到奖励。
人物3级以后找村子左上方的渔民要任务，获得采药任务，折回到黑森林搜索右上角草丛会触发战斗，人物5级后可以很轻松打败怪物获得紫堇草。（此地图上的怪物相对比较弱，而且人物升级很快）
回到村子与村口的渔民对话得知村里的女人被无道寨的山贼抓走了，之后回大地图去地图南面的山寨，山寨大王会需要你寻找西瓜刀（西瓜刀的位置在地图右侧的石头处），找到西瓜刀后交给山寨大王与其战斗击败他（山寨盗贼具有偷窃的技能，每次100金），之后与无道天狂发生战斗不敌（这里与无道天狂发有二次战斗，打不过无道天狂也不要紧，剧情依然可以进行），被扔进夜叉池，得夜叉魔体，性情大变夜叉魔体威力无穷，吓跑了无道天狂，魔体效果暂时消失，无道寨任务结束。（游戏中依然延续了一代的正、邪路线，人物特定对话选择对游戏的剧情路线至关重要）
出寨遇神机，指点穿过雪芒山脉，会有奇遇。（路上连续两次遭到保卫小鸟的母鸟攻击，第二次逃跑则游戏继续向正道结局进行），到达山顶步惊云发生神智混乱与王母发生冲突，被击败后，其女雪缘将之救下。
第三章 桃园奇遇
王母让其和雪缘去神守阁击败女将，取“无字天书” （守神阁地处大地图右上角）。首先要打开二层地图左侧的机关消弱神守阁女将的能力将其败女将，取得“无字天书”，步惊云的夜叉魔体被引发，欲对雪缘不轨，神机突然出现制住步惊云，并告诉他们炼化池（炼化池位于大地图右侧）能消步惊云魔性。炼化池中，步惊云在炼化池中击败夜叉魔体功效被化解。雪缘在回村后突然得了怪病，需要雷风塔的驱魔珠解救。在雷风塔（大地图左侧）遇险，被聂风所救，合力打败风雷二神，取得驱魔珠（游戏进行到这里就可以知道玩家所走是正道和魔道了，正道聂风帮助你时使用的是斜看苍生，反之入魔道）。解救雪缘后，听说有人夜探桃源，王母也不见了。南方有奇怪的的灵异事件，前去查看。（桃园任务结束）
第四章 邪魔附体
发现无道天狂又在为非作歹，消灭他（建议人物25左右再去做这个人物，无道天狂可以把造成的伤害转换为自己的HP，所以需要准备充足的恢复道具，以应付持久的战斗），但是被其侵入了步惊云的魂魄。被邪恶的步惊云带向神的领域的结界石（结界石地图位于大地图右下角），破除3处结界石。进入神的领域——鬼谷、哭池、狼蜂、嚎洞进入神的宫殿的正厅。（嚎洞地图有装备和道具购买，如果是魔道结局在这里尽可能购买最好的装备和恢复道具，之后会发生连续战斗，超强力的BOSS等待着你的挑战）
第五章 正邪之争
神的宫殿的正厅可能发生两种结局。
正路线：遇见神，步惊云身体中邪恶的灵魂被神湮灭。并告诉步惊云和神的关系，雪缘和聂风被神抓走。步惊云在侧厅遇到王母和神机，知道了事情真相和神的阴谋。救出同伴，被神机出卖，引到血牢之中。神借助步惊云进行同化，获得重生。与神战斗，击败神，但是无法完全消灭神，此时。王母引暴血牢与神同归于尽。众人靠血石逃脱，雪缘为救苍生离步惊云而去，游戏结束。（建议等级在32级以上装备高级物品可以完成此任务）
邪路线：邪恶值过强，神欲净化步惊云，反被其替换心智。侵占了神身体的邪恶步惊云欲杀光他们，神机出现，用血石救了他们。神变相获得了年轻的生命，击败王母。击败雪缘和聂枫，击败邪恶的步惊云。（建议人物等级到达36级以上且装备有高级物品时可以完成此任务，消耗品需准备充足，由于魔道剧情中无任何队友帮助所以只能靠一人过，游戏难度有所增加）
结尾
《风云2搜神篇》是贯穿于第一部梦情篇，搜神篇的游戏结合正反两条路线更多的增加了游戏的可玩性，步惊云的前途将会由自己的性情产生截然不同的结局，继续期待风云的后作吧！
